樹種選擇的總要求是"定向、穩定、豐產、優質、高效"，同時明確了5條具體原則：一是與立地條件相適應，體現適地適樹;二是與主導目標相適應，體現定向培育;三是優先選擇優良鄉土樹種，體現穩定、優質;四是慎用外來樹種,需要引進外來樹種時，應選擇經引種試驗并符合GB/T 14175林木引種規定的樹種，防止外來樹種入侵，體現病蟲害防治;五是易引起地力衰退的樹種，種植一、二代后應更換，保證豐產、高效。研究表明，杉木三耕土比頭耕土下降兩個地位級,二、三代杉木林產量分別比一代林下降28%和69%,北方落葉松二代林產量比一代林下降15.1%。同樣,連栽也導致了林地肥力下降，二、三代杉木林土壤化學性質指標分別比一代下降10%-20%、40%-50%。因此種植一、二代后更換樹種，對于提高林地生產力和土壤肥力十分重要。

　　同時，《新規程》分五大林種對樹種選擇要點進行了規定，對防護林提出5條選擇要點;對用材林、經濟林、能源林、特用林都分別提出要求。其中，根據各地實踐，將五大林種的薪炭林改為能源林，能源林樹種選擇分別木質燃料林和油料林兩類培育目的進行規定，增加了油料林樹種選擇要點。